第7轮： 
9月30日，星期六 
釜山i-帕克 0-2 城南一和 
水原三星 1-0 光州尚武 
仁川联合 1-1 浦项制铁 
大田市民 0-1 济州联合 
庆南FC 0-2 全南天龙 
大邱FC 2-0 FC首尔 
10月1日，星期日 
蔚山现代 0-0 全北现代

第8轮： 
10月3日，星期二 
浦项制铁 4-1 釜山i-帕克 
仁川联合 1-0 大田市民 
济州联合 0-0 大邱FC 
全南天龙 1-0 水原三星 
城南一和 3-0 庆南FC 
10月4日，星期三 
光州尚武 2-1 全北现代 
FC首尔 2-2 蔚山现代

第9轮： 
10月14日，星期六 
蔚山现代 2-2 济州联合 
全北现代 1-0 全南天龙 
光州尚武 0-2 FC首尔 
水原三星 3-0 城南一和 
庆南FC 1-0 釜山i-帕克 
10月15日，星期日 
大田市民 2-1 浦项制铁 
大邱FC 3-2 仁川联合

第10轮： 
10月21日，星期六 
浦项制铁 2-0 庆南FC 
济州联合 1-0 光州尚武 
釜山i-帕克 0-2 水原三星 
全南天龙 0-2 FC首尔 
10月22日，星期日 
大田市民 0-1 大邱FC 
仁川联合 1-0 蔚山现代 
城南一和 3-3 全北现代

第11轮： 
10月25日，星期三 
大邱FC 1-1 浦项制铁 
水原三星 2-0 庆南FC 
全北现代 0-2 釜山i-帕克 
全南天龙 2-1 济州联合 
蔚山现代 3-1 大田市民 
光州尚武 2-0 仁川联合 
FC首尔 2-2 城南一和

第12轮： 
10月29日，星期日 
浦项制铁 2-0 水原三星 
大邱FC 0-1 蔚山现代 
庆南FC 3-0 全北现代 
大田市民 3-1 光州尚武 
釜山i-帕克 1-1 FC首尔 
仁川联合 0-2 全南天龙 
城南一和 3-3 济州联合

第13轮：
11月5日，星期日
蔚山现代 0-1 浦项制铁
全北现代 1-1 水原三星
光州尚武 0-1 大邱FC
FC首尔 1-0 庆南FC
全南天龙 2-2 大田市民
济州联合 0-1 釜山i-帕克
城南一和 0-0 仁川联合
 
第二阶段最终积分榜：
（截至11月5日）
  球队       场 胜 平 负 进球 失球 积分
 1 水原三星   13  8  3  2  18    9   27 (年度总冠军附加赛)
 2 浦项制铁   13  7  4  2  21   13   25 (年度总冠军附加赛)
 3 FC首尔     13  6  5  2  18   12   23 (年度总冠军附加赛)
----------------------------------------
 4 大邱FC     13  6  3  4  18   14   21 
 5 蔚山现代   13  5  5  3  12    9   20 
 6 仁川联合   13  5  4  4  13   14   19 
 7 釜山i-帕克 13  5  3  5  16   17   18 
 8 全南天龙   13  5  2  5  14   13   17 
 9 城南一和   13  4  4  4  21   16   16 
10 济州联合   13  4  4  5  15   16   16 
11 庆南FC     13  4  1  8  12   20   13 
12 大田市民   13  3  3  7  15   22   12 
13 全北现代   13  2  4  7  11   20   10 
14 光州尚武   13  3  1  9   7   16   10 
（注：浦项制铁以第一阶段亚军身份进入年度总冠军附加赛，其空缺名额由FC首尔递补）

2006年总冠军附加赛： 
半决赛： 
11月11日，星期六 
城南一和 1-0 FC首尔 
11月12日，星期日 
水原三星 1-0 浦项制铁 

决赛： 
第一回合： 
11月19日，星期日 
城南一和 1-0 水原三星 

第二回合： 
11月25日，星期六 
水原三星 1-2 城南一和 (总比分1-3)